Hoàn Thuế GTGT 2026: 7 Công Văn Cục Thuế Mới Cần Biết (Tháng 9)

Tuần 18–22/9/2026, Cục Thuế ban hành liên tiếp 7 công văn trả lời vướng mắc cho các địa phương. Điểm nóng nhất là hoàn thuế GTGT 2026 – cả hàng xuất khẩu lẫn dự án đầu tư. Bên cạnh đó là gỗ sơ chế không chịu thuế GTGT, ưu đãi thuế TNDN và lệ phí môn bài khi doanh nghiệp "bỏ địa chỉ".

Bảng tổng hợp văn bản mới

1. Hoàn thuế GTGT hàng xuất khẩu (CV 7018, CV 6980)

Trong tháng/quý có hàng hóa, dịch vụ xuất khẩu mà thuế GTGT đầu vào chưa khấu trừ hết từ 300 triệu đồng trở lên thì được xem xét hoàn theo tháng/quý (trừ hàng nhập khẩu rồi xuất khẩu sang nước khác).

• Cách tính số hoàn: theo Điều 7 TT 69/2025/TT-BTC – cộng thuế đầu vào kỳ trước chuyển sang và phát sinh trong kỳ (kể cả TSCĐ) dùng cho xuất khẩu.
• Kê khai: theo mẫu tờ khai TT 81/2021/TT-BTC (sửa đổi bởi TT 40/2025/TT-BTC).

Hiểu đơn giản: phải tách được thuế đầu vào phục vụ xuất khẩu, nếu không số hoàn dễ bị giảm do phân bổ.

2. Hoàn thuế GTGT dự án đầu tư (CV 7019)

Pháp luật không lấy ngày cấp Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư làm mốc xác định thuế GTGT đầu vào của dự án.

• Hóa đơn phát sinh trước ngày cấp GCN ĐKĐT vẫn được xét khấu trừ, hoàn thuế nếu chứng minh phục vụ chuẩn bị/thực hiện dự án.
• Hồ sơ: hóa đơn, chứng từ thanh toán, hợp đồng thuê đất, tài liệu xác định địa điểm dự án (điểm b khoản 1 Điều 46 TT 89/2026/TT-BTC).

3. Gỗ sơ chế thông thường & hóa đơn sai thuế suất (CV 7021)

• Gỗ tròn, thanh gỗ đã cưa, xẻ nhưng chưa bào, chưa tẩm hóa chất, chưa sấy → không chịu thuế GTGT ở khâu sản xuất bán ra và nhập khẩu.
• Hóa đơn lập sai thuế suất: xử lý theo NĐ 70/2025/NĐ-CP (hóa đơn trước 01/7/2026) và điểm b khoản 1 Điều 10 TT 91/2026/TT-BTC.
• Thuế GTGT đã nộp khâu nhập khẩu: liên hệ hải quan để xử lý.

4. Thu nhập nào được ưu đãi thuế TNDN? (CV 7022)

Dự án ưu đãi theo lĩnh vực thì thu nhập liên quan trực tiếp cũng được ưu đãi: thanh lý phế liệu, chênh lệch tỷ giá gắn với hoạt động ưu đãi, lãi tiền gửi không kỳ hạn…

• Lãi tiền gửi có kỳ hạn: xử lý theo quy định thu nhập khác.
• Tiền bồi thường: chỉ được ưu đãi nếu gắn trực tiếp với vận hành, sản xuất của dự án.

5. Lệ phí môn bài khi DN không hoạt động tại địa chỉ (CV 6938)

DN bị thông báo không hoạt động tại địa chỉ đăng ký vẫn phải thực hiện nghĩa vụ thuế. Khi chấm dứt MST phải nộp đủ hồ sơ, tiền thuế (kể cả môn bài), xử lý tiền nộp thừa và thuế GTGT chưa khấu trừ (NĐ 252/2026/NĐ-CP, Điều 14 TT 90/2026/TT-BTC).

Lưu ý thêm: NĐ 363/2026/NĐ-CP về xử phạt trong lĩnh vực dữ liệu có hiệu lực từ 11/11/2026.

Ứng dụng thực tế: kế toán cần làm gì ngay?

1. Theo dõi riêng thuế đầu vào cho xuất khẩu, kiểm tra ngưỡng 300 triệu trước khi nộp hồ sơ hoàn.
2. Gom hóa đơn phát sinh trước ngày cấp GCN ĐKĐT kèm chứng cứ phục vụ dự án.
3. Rà soát hóa đơn bán hàng nông, lâm sản sơ chế; điều chỉnh/thay thế nếu sai thuế suất.
4. Quyết toán TNDN: tách lãi có kỳ hạn, tiền bồi thường khỏi thu nhập ưu đãi.
5. Kiểm tra tình trạng MST của chi nhánh; hoàn tất nghĩa vụ trước khi đóng MST.
6. Rà soát phân quyền, lưu trữ dữ liệu kế toán trước 11/11/2026.

Câu hỏi thường gặp

Hóa đơn mua trước khi có GCN đầu tư có được hoàn thuế GTGT không? Có thể được, nếu chứng minh phục vụ dự án và đủ điều kiện khấu trừ.

Ngưỡng hoàn thuế GTGT xuất khẩu là bao nhiêu? Từ 300 triệu đồng thuế đầu vào chưa khấu trừ hết trong tháng/quý.

Bán gỗ xẻ chưa sấy có phải tính thuế GTGT? Không, đây là sản phẩm sơ chế thông thường, không chịu thuế GTGT.

Lãi tiền gửi có kỳ hạn có được ưu đãi TNDN? Không đương nhiên; ưu đãi áp dụng cho lãi không kỳ hạn liên quan trực tiếp.

Kết luận

Các công văn tháng 9/2026 tiếp tục làm rõ điều kiện hoàn thuế GTGT 2026 và ranh giới thu nhập ưu đãi TNDN. Công văn cá biệt không phải văn bản quy phạm, nhưng là kim chỉ nam để kế toán chủ động chuẩn bị hồ sơ, tránh bị loại số hoàn hoặc truy thu.

Bài gốc: ketoanstartup.com